O edifício actua foi edificado no século XVIII mas a construção primitiva remontava ao período medieval, sendo mesmo anterior à nacionalidade. Uma antiga tradição lembra que durante a ocupação árabe de Viseu, 981 a 1058, era esse o local onde era permitido aos cristãos celebrar o seu culto.
Uma antiga lenda diz que em São Miguel do Fetal repousam os restos mortais do último rei Godo, o Rei Rodrigo, que aí encontrou refúgio e terminou os seus dias como penitente incógnito. Existindo mesmo uma arca tumular, executada tardiamente e vazia. Nas traseiras do actual altar-mor existe um arco de volta inteira que se pensa ter pertencido a edificação anterior que estava arruinada . O actual templo foi edificado entre 1736/39, porque o anterior ameaçava ruína e estava já escorado. A construção tem sinais de matriz maneirista, com remate de fachada e janelas de frontão triangular, nos vértices da cobertura possui pináculos piramidais com esferas. No interior existe um retábulo barroco joanino, datado de 1752, em branco e dourado, e dois retábulos laterais maneiristas um dos quais possui uma bela imagem de São Miguel a espezinhar o demónio.
